Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms