Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc82Q6PG04 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms