Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc4Q6PAV2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms