Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga2Q6P5E6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gga2Q6P5E6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms