Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig8Q6P3A4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms