Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc3bQ6NWW9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3bQ6NWW9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms