Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2810408A11RikQ6NSU2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms