Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5416Q6IE28 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm5416Q6IE28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm5416Q6IE28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm5416Q6IE28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm5416Q6IE28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm5416Q6IE28 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm5416Q6IE28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5416Q6IE28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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