Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2cQ69ZS6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2cQ69ZS6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms