Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prex1Q69ZK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prex1Q69ZK0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prex1Q69ZK0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms