Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms