Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim24Q64127 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms