Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CochQ62507 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CochQ62507 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CochQ62507 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CochQ62507 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CochQ62507 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CochQ62507 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CochQ62507 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CochQ62507 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CochQ62507 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CochQ62507 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CochQ62507 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CochQ62507 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CochQ62507 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CochQ62507 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CochQ62507 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CochQ62507 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CochQ62507 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CochQ62507 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CochQ62507 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CochQ62507 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CochQ62507 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CochQ62507 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CochQ62507 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CochQ62507 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CochQ62507 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CochQ62507 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CochQ62507 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CochQ62507 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CochQ62507 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CochQ62507 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CochQ62507 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CochQ62507 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CochQ62507 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CochQ62507 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CochQ62507 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CochQ62507 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CochQ62507 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CochQ62507 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CochQ62507 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CochQ62507 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CochQ62507 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CochQ62507 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms