Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhQ62361 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrhQ62361 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrhQ62361 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhQ62361 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhQ62361 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TrhQ62361 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhQ62361 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhQ62361 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms