Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SypQ62277 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SypQ62277 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SypQ62277 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SypQ62277 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SypQ62277 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SypQ62277 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SypQ62277 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SypQ62277 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SypQ62277 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SypQ62277 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SypQ62277 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SypQ62277 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SypQ62277 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SypQ62277 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SypQ62277 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms