Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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