Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema3cQ62181 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema3cQ62181 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms