Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctr9Q62018 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctr9Q62018 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms