Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Lrrn1Q61809 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Lrrn1Q61809 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lrrn1Q61809 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn1Q61809 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lrrn1Q61809 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrn1Q61809 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrn1Q61809 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrn1Q61809 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrn1Q61809 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrn1Q61809 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Lrrn1Q61809 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Lrrn1Q61809 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn1Q61809 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms