Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga6Q61739 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga6Q61739 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga6Q61739 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms