Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna11Q61716 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms