Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrxQ61687 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms