Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pacsin1Q61644 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin1Q61644 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin1Q61644 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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