Protein–RNA interactions for Protein: Q61496

Ddx4, ATP-dependent RNA helicase DDX4, mousemouse

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Length 702 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx4Q61496 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Ddx4Q61496 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx4Q61496 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx4Q61496 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx4Q61496 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx4Q61496 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx4Q61496 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx4Q61496 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Ddx4Q61496 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Ddx4Q61496 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Ddx4Q61496 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Ddx4Q61496 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Ddx4Q61496 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx4Q61496 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Ddx4Q61496 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Ddx4Q61496 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Ddx4Q61496 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Ddx4Q61496 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ddx4Q61496 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx4Q61496 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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