Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne1Q61457 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne1Q61457 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms