Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcanQ61361 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BcanQ61361 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BcanQ61361 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcanQ61361 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms