Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acvr1bQ61271 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acvr1bQ61271 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms