Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc6Q61143 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms