Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgaeQ60677 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgaeQ60677 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms