Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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PtprnQ60673 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprnQ60673 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprnQ60673 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprnQ60673 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprnQ60673 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms