Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClpbQ60649 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClpbQ60649 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClpbQ60649 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClpbQ60649 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClpbQ60649 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClpbQ60649 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClpbQ60649 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClpbQ60649 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms