Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Specc1Q5SXY1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Specc1Q5SXY1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Specc1Q5SXY1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms