Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms