Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggnbp2Q5SV77 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ggnbp2Q5SV77 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ggnbp2Q5SV77 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ggnbp2Q5SV77 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ggnbp2Q5SV77 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms