Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sco1Q5SUC9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Sco1Q5SUC9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sco1Q5SUC9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.4 ms