Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav2Q5R1I9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav2Q5R1I9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms