Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rapgef6Q5NCJ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rapgef6Q5NCJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rapgef6Q5NCJ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms