Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd1Q5M956 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd1Q5M956 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms