Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hs3st6Q5GFD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hs3st6Q5GFD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms