Protein–RNA interactions for Protein: Q5F201

Cfap52, Cilia- and flagella-associated protein 52, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap52Q5F201 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap52Q5F201 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap52Q5F201 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap52Q5F201 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms