Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ndufaf2Q59J78 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufaf2Q59J78 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms