Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eme2Q56A04 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms