Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
6430531B16RikQ3V2J1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 437 ms