Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700057G04RikQ3V0U0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700057G04RikQ3V0U0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms