Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc114Q3UX62 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc114Q3UX62 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc114Q3UX62 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms