Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnga4Q3UW12 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga4Q3UW12 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms