Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUX7

Uncharacterized protein C4orf46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UUX7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UUX7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UUX7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3UUX7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3UUX7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms