Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgef9Q3UTH8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgef9Q3UTH8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms