Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fchsd2Q3USJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fchsd2Q3USJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fchsd2Q3USJ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fchsd2Q3USJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fchsd2Q3USJ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fchsd2Q3USJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms