Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TceancQ3US16 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms